Объединение ведет свою историю с 15 января 1993 года, когда на основании Указа Президента Российской Федерации был образован Северо-Кавказский округ внутренних войск МВД России. 

За три десятилетия своей истории округ не единожды реформировался, развивался с учетом складывающейся обстановки на юге страны, а в 2016 году вошел в состав войск национальной гвардии.

Сегодня личный состав округа продолжает успешно выполнять задачи, возложенные на войска национальной гвардии, в том числе в рамках проведения специальной военной операции.